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中科院微生物所建成人肠路菌株资源库 |
| 功夫：2021-06-08 起源：中国科学报 |
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含400种分歧物种及24种肠路微生物“暗物种”
肠路微生物与宿主健全和成长发育亲昵有关。微生物所供图 近日，中科院微生物所钻研员刘双江团队构建了蕴含400个分歧物种的健全人群肠路微生物菌株资源库（hGMB），有关成就颁发于《微生物组》期刊。 越来越多的证据批注，肠路微生物与宿主健全和成长发育亲昵有关。目前，仅有不及半数的肠路微生物物种，成功地在尝试室获得纯造就和定名。肠路微生物菌株资源的匮乏，极大的限度了肠路微生物的利用与钻研。 这次他与团队构建的hGMB蕴含400个分歧的物种，其中有102个物种为初次分离、造就和鉴定，1170株代表性菌株保留在中国通常微生物菌种珍藏中心，已经向科研界和产业界提供了数次菌株服务，支持肠路微生物职能开发和微生物-宿主互作的钻研。为了充分阐扬和挖掘菌株资源的价值，该资源库物种信息已在网站（hgmb.nmdc.cn）颁布。 据介绍，hGMB的构建历时两年，钻研团队从239例来自分歧地域和分歧春秋的体检健全人群的新鲜粪便样品中挑取超过2万个单克隆，扩大造就后从中鉴定出超过1万个纯培营养离株。通过对健全人肠路宏基因组分析，发现该菌株资源库中的85个新物种呈此刻超过90%健全人肠路中，同时覆盖79%人肠路已知常见属和75%常见物种。 与目前最大的人肠路基因组数据库（UHGG）对比，hGMB贡献了24个在肠路免造就组学钻研中未被探测到却普遍存在的“暗物种”。 作者暗示，鉴于肠路微生物菌株资源库的建设是开发利用肠路微生物的基础，是认知宿主—微生物互作机造中至关沉要的一环，构建中华肠路微生物资源库拥有长远的战术意思和经济社会价值。 去年，该团队还颁发了迄今为止最大的模式动物幼鼠肠路微生物资源库（mGMB），蕴含126种微生物及其基因组，其中77种微生物是初次成功分离造就的新物种，使得可造就的幼鼠肠路微生物菌株资源从48个属增长到110个属、从76种增长到180种，且在此过程中形成了一套厌氧微生物分离造就与物种鉴定描述的最简尺度化流程。 有关论文信息：https://doi.org/10.1186/s40168-021-01064-3 |
